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MDL/OMOP

Desarrollo de registros de enfermedades con el repositorio OMOP CDM

Vea cómo Clinovera desarrolló una plataforma basada en la nube para registros de enfermedades raras, integrando datos de diversas fuentes en el repositorio de OMOP CDM con amplias herramientas de modelado de datos y gestión de contenido, utilizando la experiencia de un equipo multidisciplinario en OMOP CDM para investigación y análisis.
Desarrollo del registro de enfermedades raras
Publicado en
September 27, 2023

Acerca del cliente

Nuestro cliente, una empresa innovadora que ha desarrollado una plataforma para registros de enfermedades raras, está creando registros y apoyando investigaciones relacionadas en varios países. Cada registro agrega datos de múltiples fuentes, incluidos EHR y otros sistemas.

La representación operativa interna de los datos del paciente se basa en el modelo de datos de código abierto OHDSI OMOP/CDM. La empresa también ha estado desarrollando una amplia infraestructura técnica y de gestión de contenidos, así como el modelo de metadatos necesario y la extensión CDM para respaldar sus objetivos comerciales.

Nuestro cliente tiene varios equipos distribuidos que operan en tres continentes y trabajan en colaboración entre sí y con los clientes.

Alcance y detalles del compromiso

Nuestro cliente contrató a Clinovera para capitalizar nuestra amplia experiencia en atención médica y ciencias biológicas, así como nuestra experiencia con CDM de OMOP (Observational Medical Outcomes Partnership).

Incorporamos un equipo multidisciplinario para trabajar en estrecha colaboración con el liderazgo y la gestión del cliente utilizando procesos ágiles.

Como parte de este compromiso, trabajamos con una amplia gama de tareas operativas y de infraestructura centradas en datos, que incluyen:

  • Desarrollar rápidamente una plataforma interactiva basada en la nube de múltiples inquilinos para la recopilación de datos que admita flujos de trabajo y lógica para médicos, pacientes e investigadores;
  • Construir un canal de integración con instituciones de atención médica que utilice funciones inteligentes de comparación de pacientes, elaboración de perfiles y calidad de datos;
  • Adquisición, transformación y mapeo de datos de pacientes de diferentes sistemas EHR y fuentes de datos heredados a OMOP CDM;
  • Modelado de datos para numerosas entidades de observación de enfermedades específicas de alta complejidad en apoyo de enfermedades y flujos de trabajo específicos;
  • Desarrollar herramientas e infraestructura de gestión de contenidos clínicos para la colaboración de investigadores y médicos.

Aspectos destacados de la implementación técnica

  • Solución multiinquilino basada en la nube alojada en Microsoft Azure;
  • Pila de tecnología: arquitectura de una sola página, Angular JS, Java Bootstrap, microservicios, base de datos de Microsoft SQL Server, Forgerock;
  • El proceso de integración se basa en la infraestructura de Intersystems HealthConnect;
  • Emparejamiento inteligente de pacientes mediante algoritmos y software de aprendizaje automático de código abierto;
  • Almacenamiento persistente en OMOP CDM y extensiones; el almacenamiento oculto para la interfaz de usuario está en JSON;
  • Conversión de datos de fuentes externas en CCDA, FHIR, HL7, interfaces propietarias y formatos de datos a OMOP CDM y JSON.

Acerca de OHDSI OMOP CDM

OMOP es un modelo de datos común (CDM) de código abierto, un estándar para la representación de datos de observación utilizados para realizar investigaciones de evidencia del mundo real (RWE). Cuenta con el apoyo y mantenimiento de la comunidad internacional OHDSI.

OMOP CDM es altamente extensible y puede acomodar extensiones y entidades personalizadas fuera del modelo estándar. Tradicionalmente, OMOP CDM no se utiliza como almacén de datos operativos, pero con las extensiones e indexación adecuadas hemos podido adaptar este CDM a las necesidades del cliente.

Acerca del cliente Nuestro cliente, una empresa innovadora que ha desarrollado una plataforma para registros de enfermedades raras, está creando registros y apoyando investigaciones relacionadas en varios países. Cada registro agrega datos de múltiples fuentes, incluidos EHR y otros sistemas.

La representación operativa interna de los datos del paciente se basa en el modelo de datos de código abierto OHDSI OMOP/CDM. La empresa también ha estado desarrollando una amplia infraestructura técnica y de gestión de contenidos, así como el modelo de metadatos necesario y la extensión CDM para respaldar sus objetivos comerciales.

Nuestro cliente tiene varios equipos distribuidos que operan en tres continentes y trabajan en colaboración entre sí y con los clientes.

Alcance y detalles del compromiso

Nuestro cliente contrató a Clinovera para capitalizar nuestra amplia experiencia en atención médica y ciencias biológicas, así como nuestra experiencia con CDM de OMOP (Observational Medical Outcomes Partnership).

Incorporamos un equipo multidisciplinario para trabajar en estrecha colaboración con el liderazgo y la gestión del cliente utilizando procesos ágiles.

Como parte de este compromiso, trabajamos con una amplia gama de tareas operativas y de infraestructura centradas en datos, que incluyen:

Una plataforma interactiva basada en la nube de múltiples inquilinos para la recopilación de datos que respalda flujos de trabajo y lógica para médicos, pacientes e investigadores en rápida evolución.

Construir un canal de integración con instituciones de atención médica que utilice funciones inteligentes de emparejamiento de pacientes, perfiles de datos y calidad de datos.

Adquisición, transformación y mapeo de datos de pacientes de diferentes sistemas EHR y fuentes de datos heredadas a OMOP CDM

Modelado de datos para numerosas entidades de observación de enfermedades específicas de alta complejidad en apoyo de enfermedades y flujos de trabajo específicos.

Desarrollar herramientas e infraestructura de gestión de contenido clínico para la colaboración de investigadores y médicos.

Experiencia de Clinovera en OMOP/CDM

Clinovera cuenta con un equipo de analistas, informáticos médicos e ingenieros con amplia experiencia en OMOP CDM que han estado mapeando y extrayendo datos de observación de una variedad de fuentes de datos, modelando entidades de observación complejas y desarrollando herramientas y aplicaciones en torno a OMOP CDM para investigación y análisis.

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