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MDP/OMOP

Développement de registres de maladies avec le référentiel OMOP CDM

Découvrez comment Clinovera a développé une plateforme cloud pour les registres de maladies rares, intégrant des données provenant de diverses sources dans le référentiel OMOP CDM avec des outils étendus de modélisation de données et de gestion de contenu, en utilisant l'expertise d'une équipe multidisciplinaire dans OMOP CDM pour la recherche et l'analyse.
Développement d'un registre de maladies rares
Publié le
September 27, 2023

À propos du client

Notre client, une entreprise innovante qui a développé une plateforme pour les registres de maladies rares, crée des registres et soutient la recherche connexe dans plusieurs pays. Chaque registre regroupe des données provenant de plusieurs sources, notamment le DSE et des autres systèmes.

La représentation opérationnelle interne des données des patients est basée sur le modèle de données open source OHDSI OMOP/CDM. La société a également développé une infrastructure technique et de gestion de contenu étendue, ainsi que le modèle de métadonnées et l'extension CDM nécessaires à l'appui de ses objectifs commerciaux.

Notre client dispose de plusieurs équipes réparties opérant sur trois continents travaillant en collaboration entre elles et avec les clients.

Portée et détails de la mission

Notre client a engagé Clinovera pour capitaliser sur notre vaste expérience dans les domaines de la santé et des sciences de la vie, ainsi que sur notre expérience avec l'expertise CDM OMOP (Observational Medical Outcomes Partnership).

Nous avons fait appel à une équipe multidisciplinaire pour travailler en étroite collaboration avec les dirigeants et la direction du client en utilisant des processus agiles.

Dans le cadre de cet engagement, nous avons travaillé sur un large éventail de tâches opérationnelles et d'infrastructure axées sur les données, notamment:

  • Évolution rapide d'une plate-forme interactive cloud multi-locataires pour la collecte de données qui prend en charge les flux de travail et la logique pour les cliniciens, les patients et les chercheurs;
  • Construire un pipeline d'intégration avec les établissements de santé qui utilise des fonctions intelligentes d'appariement des patients, de profilage des données et de qualité des données ;
  • Acquisition, transformation et cartographie des données des patients provenant de différents systèmes de DSE et sources de données existantes vers OMOP CDM ;
  • Modélisation de données pour de nombreuses entités d'observation spécifiques à une maladie et d'une grande complexité à l'appui de maladies et de flux de travail spécifiques ;
  • Développer des outils et une infrastructure de gestion de contenu clinique pour la collaboration des chercheurs et des cliniciens.

Points saillants de la mise en œuvre technique

  • Solution multi-tenant basée sur le cloud hébergée dans Microsoft Azure ;
  • Pile technologique : architecture monopage, Angular JS, Java Bootstrap, microservices, base de données Microsoft SQL Server, Forgerock ;
  • Le pipeline d'intégration est basé sur l'infrastructure Intersystems HealthConnect;
  • Appariement intelligent des patients à l’aide de logiciels et d’algorithmes d’apprentissage automatique open source ;
  • Stockage persistant dans OMOP CDM et extensions ; le stockage fantôme pour l'interface utilisateur est en JSON ;
  • Conversion de données à partir de sources externes en CCDA, FHIR, HL7, interfaces propriétaires et formats de données vers OMOP CDM et JSON.

À propos de l’OHDSI OMOP MDP

OMOP est un modèle de données commun (CDM) open source, une norme de représentation des données d'observation utilisées pour mener des recherches sur les preuves du monde réel (RWE). Il est soutenu et maintenu par la communauté internationale OHDSI.

OMOP CDM est hautement extensible et peut accueillir des extensions et des entités personnalisées en dehors du modèle standard. Traditionnellement, OMOP CDM n'est pas utilisé comme magasin de données opérationnel, mais avec les extensions et l'indexation appropriées, nous avons pu adapter ce CDM aux besoins du client.

À propos du client Notre client, une entreprise innovante qui a développé une plateforme pour les registres de maladies rares, crée des registres et soutient la recherche connexe dans plusieurs pays. Chaque registre regroupe des données provenant de plusieurs sources, notamment le DSE et d'autres systèmes.

La représentation opérationnelle interne des données des patients est basée sur le modèle de données open source OHDSI OMOP/CDM. La société a également développé une infrastructure technique et de gestion de contenu étendue, ainsi que le modèle de métadonnées et l'extension CDM nécessaires à l'appui de ses objectifs commerciaux.

Notre client dispose de plusieurs équipes réparties opérant sur trois continents travaillant en collaboration entre elles et avec les clients.

Portée et détails de la mission

Notre client a engagé Clinovera pour capitaliser sur notre vaste expérience dans les domaines de la santé et des sciences de la vie, ainsi que sur notre expérience avec l'expertise CDM OMOP (Observational Medical Outcomes Partnership).

Nous avons fait appel à une équipe multidisciplinaire pour travailler en étroite collaboration avec les dirigeants et la direction du client en utilisant des processus agiles.

Dans le cadre de cet engagement, nous avons travaillé sur un large éventail de tâches opérationnelles et d'infrastructure axées sur les données, notamment:

Plateforme interactive cloud multi-tenants en évolution rapide pour la collecte de données qui prend en charge les flux de travail et la logique pour les cliniciens, les patients et les chercheurs.

Créer un pipeline d'intégration avec les établissements de santé qui utilise des fonctions intelligentes d'appariement des patients, de profilage des données et de qualité des données

Acquisition, transformation et cartographie des données des patients provenant de différents systèmes de DSE et sources de données existantes vers OMOP CDM

Modélisation de données pour de nombreuses entités d'observation spécifiques à une maladie et d'une grande complexité à l'appui de maladies et de flux de travail spécifiques

Développer des outils et une infrastructure de gestion de contenu clinique pour la collaboration des chercheurs et des cliniciens.

Expertise Clinovera en OMOP/MDP

Clinovera dispose d'une équipe des analystes, des informaticiens médicaux et des ingénieurs possédant une expertise approfondie dans OMOP CDM qui ont cartographié et extrait des données d'observation à partir de diverses sources de données, modélisé des entités d'observation complexes et développé des outils et des applications autour d'OMOP CDM pour la recherche et l'analyse.

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